Vaidavas ezers atrodas Gaujas Nacionālajā parkā. Eksperti vērtē, ka pēdējo 20 gadu laikā no barības vielām vidēji bagāta ezera tas ir pārtapis par barības vielām ļoti bagātu ezeru, kas arī veicina ezera krastu aizaugšanu ar niedrēm.
Tas novērojams ezera ziemeļu daļā, kur ieplūst ūdeņi no notekūdeņu attīrīšanas iekārtām.
Ūdensaugiem atmirstot, veidojas dūņu slānis, līdz ar to piekļuve atklātajam ūdenim šādās vietās ir apgrūtināta. Jāpiebilst, ka arī aizvadītajā gadā ezerā Dabas aizsardzības pārvalde Vaidavas ezerā rīkoja niedru pļaušanu, lai mazinātu piekrastes aizaugšanu.