Aldona Berķe 1957. gadā absolvējusi Latvijas Valsts universitātes inženierceltniecības fakultātes arhitektūras nodaļu. Bijusi Latvijas Arhitektu savienības biedre no 1967. gada.
Berķe darba gaitas uzsākusi kā arhitekte PSRS projektēšanas institūtā “Giprotorg” Latvijas filiāles darbnīcā. Laikā no 1960. līdz 1964. gadam kā vecākā arhitekte strādājusi Rīgas ģenerālplāna birojā.
Pēc Rīgas ģenerālplāna biroja reorganizācijas no 1965. līdz 1992. gadam Aldona Berķe strādājusi kā vecākā arhitekte un grupas vadītāja LPSR Valsts pilsētu celtniecības projektēšanas institūta “Pilsētprojekts” Pilsētbūvniecības darbnīcā. Autoru kolektīvā piedalījusies Rīgas ģenerālplāna izstrādāšanā (1965, 1984). Projekti – Ļeņina ielas (tagadējās Brīvības ielas) rekonstrukcijas projekts Rīgā, Rīgas centra rekonstrukcijas projekts (1974-1980), Rīgas pazemes urbanizācija (1975-1978), Ķengaraga, Pleskodāles – Zolitūdes, Āgenskalna (1976), Sarkandaugavas – Aplokciema, Mārupes – Bieriņu, Ziepniekkalna – Torņakalna – Katlakalna (1971), Bolderājas (1989) dzīvojamo rajonu detālplānojumu projekti, Daugavpils ģenerālā plāna un pils centra rekonstrukcijas izstrādāšana (1984). Pēc Berķes projektiem apbūvēti dzīvojamie mikrorajoni Dzirciema ielā, Gulbju ielā Rīgā, kā arī Olainē (1973-1977). Saņēmusi Latvijas PSR Ministru Padomes prēmiju par Pleskodāles – Zolitūdes dzīvojamo rajonu projektiem (1973).
Pēc 1992. gada darba gaitas turpinājusi A/S "Pilsētprojekts", kā arī veicot līgumdarbus.